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常见的转录组测序技术平台包括Illumina HiSeq、NovaSeq和BioNano Genomics等。Illumina平台因其高通量和高准确性而广泛应用于转录组测序。
参考基因组选择:根据具体研究目的和样本特点选择最适合的参考基因组。对于高变异的样本,可以选择一致性较高的参考基因组进行比对。
比对率低:选择合适的比对工具(如Bowtie、BWA等)进行比对。
常用的SNP检测方法包括直接测序法、Taqman探针法、HRM法、焦磷酸测序法、SNaPShot和Sequenom法等。
需要确保数据的准确性和重复性,使用适当的软件进行数据分析,仔细检查突变位点和相关序列。
可以鉴定细菌、真菌等微生物,包括病原菌和环境微生物。
样品可以是细菌或真菌的纯培养物(菌液、菌株),或环境样品(如土壤、水样等)。
答:溶解DNA测序样品时,用灭菌蒸馏水溶解最好。DNA的测序反应也是Taq酶的聚合反应,需要一个最佳的酶反应条件。如果DNA用缓冲液溶解后,在进行了测序反应时,DNA溶液中的缓冲液组份会影响测序反应的体系条件,造成Taq酶的聚合性能下降。 有很多客户在溶解DNA测序样品时使用TE Buffer。的确,TE Buffer能增加DNA样品保存期间的稳定性, 但TE Buffer对DNA测序反应有影响,根据我们的经验,我们还是推荐使用灭菌蒸馏水来溶解DNA测序样品。
答:我们推荐客户提供菌体,由我们来提取质粒,这样DNA样品比较稳定。如果您要以提供DNA样品,我们也很欢迎,但一定要注意样品纯度和数量。提供的测序样品为PCR产物时,特别需要注意DNA的纯度和数量。PCR产物应该进行切胶回收,否则无法得到良好的测序效果。有关DNA测序样品的详细情况请严格参照“DNA测序样品准备及注意事项”部分的说明。
答:一般菌体的形态有:平板培养菌、穿刺培养菌,甘油保存菌或新鲜菌液等。我们提倡寄送穿刺培养菌或新鲜菌液。平板培养菌运送特别不方便,我们收到的一些平板培养菌的培养皿在运送过程中常常已经破碎,面目全非,需要用户重新寄样。这样既误时间,又浪费客户的样品。一旦是客户非常重要的样品时,其后果更不可设想。而甘油保存菌则容易污染。制作穿刺菌时,可在1。5ml的Tube管中加入琼脂培养基,把菌体用牙签穿刺于琼脂培养基(固体)中,37℃培养一个晚上后便可使用。穿刺培养菌在4℃下可保存数个月,并且不容易污染,便于运送。
如果您需要对过表达或者表达降低目的基因的细胞进行反复试验,那么构建稳定细胞株是有必要的。 第一,可以减少不同批次实验中转染效率差异带来的实验结果差异,提高实验的可重复性。 第二,构建好细胞系后不必再进行瞬时转染实验以及反复制备质粒,减少工作量。 第三,不再使用价格高昂的转染试剂,节约实验成本。
不是所有的细胞株都能构建成为稳定细胞系的。构建稳定细胞系需要满足2个条件:
1、细胞能稳定传代;
2、细胞的转染效率满足要求。
1.一致性和重复性高:抗体生产质量可控,抗体的批次间差异小。
2.可以避免杂交瘤细胞制备中如基因丢失、基因突变和细胞株漂移等问题。
3.灵敏度和特异性强:利用重组技术,更容易通过抗体工程提高抗体特异性和灵敏度。
4.高通量、高效率:简化客户的抗体发现流程,以指定形式表达的优质抗体满足您特定的实验需求。
5.无动物体外生产。