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合成生物学底盘细胞之毕赤酵母
发布时间:2024-12-13


酵母表达系统是真核表达系统中应用最广泛的之一,其中巴斯德毕赤酵母(Komagataella phaffii,又名Pichia pastoris作为甲基营养型酵母的代表,近年来发展迅速,应用广泛。


毕赤酵母:基因表达的新纪元

毕赤酵母表达系统诞生于上世纪80 年代初期,它融合了原核表达系统与真核表达系统的诸多优点,迅速在众多表达系统中脱颖而出。与原核表达系统相比,它不仅保留了操作简易、易于培养、生长速度快、表达量高、成本低等特性,还具备原核生物所欠缺的对外源蛋白的翻译后修饰能力,如糖基化、蛋白磷酸化等,使表达的重组蛋白更接近天然产物。同时,它又克服了酿酒酵母分泌效率差、表达菌株不稳定、表达质粒易丢失等缺陷,成为外源蛋白表达的理想选择。


毕赤酵母表达系统的主要优势

1. 高效AOX1启动子:目前最强、调控机制最严谨的启动子之一,便于调控外源基因的表达。

2. 蛋白加工修饰功能:可对表达的外源蛋白进行糖基化、磷酸化、脂类酰化等翻译后修饰,使重组蛋白与天然产物更相似。

3. 低成本与高效生长:菌株生长迅速,培养基成本低廉,培养条件简单。

4. 高表达量:外源蛋白表达量高,支持胞内和分泌表达。

5. 基因稳定整合:外源基因能在基因组的特定位点以单拷贝或多拷贝形式稳定整合,可稳定遗传50代以上。

6. 高密度发酵:耐受高密度发酵,便于工业化生产。


 

P. pastoris生产重组蛋白的流程

 

毕赤酵母菌株多样性

当前所采用的巴斯德毕赤酵母菌株都源自原始的Y-11430菌,常用的有GS115、KM71、X33和SMD1168等。蛋白胞内表达优先选MutS表型,分泌表达Mut + 和MutS均可;多数菌株如SMD1168、GS115、KM-71是组氨酸脱氢酶缺陷型,可用不含组氨酸培养基筛选重组子,且SMD1168为蛋白酶缺陷型,适合表达不稳定蛋白质或蛋白质复合物以避免内源性蛋白酶降解。但SMD1168菌株生长缓慢,导致蛋白质产量低

菌株

基因型

表型

应用

X33

野生型

Mut+ His+

筛选Zeocin抗性表达载体

GS115

his4

Mut+ His-

筛选含HIS4的表达载体

KM71

his4 arg4 aox1∆::ARG4

MutS His-

筛选含HIS4的表达载体

KM71H

aox1::ARG4

arg4

MutS His+

筛选Zeocin抗生素抗性的表达载体

SMD1168

his4 pep4

Mut+ His+

在无蛋白酶A活性的酵母菌株中

筛选含HIS4的表达载体

SMD1168H

pep4

Mut+

在无蛋白酶A活性的酵母菌株中筛选Zeocin抗生素表达载体

 

毕赤酵母常用表达载体

毕赤酵母表达载体分为分泌型和非分泌型两大类,分别适用于不同类型的蛋白质生产需求,其中分泌型载体利用酿酒酵母的分泌信号序列,有效引导外源蛋白的分泌,提高了蛋白的产量和纯度。因此,深入了解和优化毕赤酵母表达载体,对于提升蛋白生产效率和质量至关重要,也是当前生物技术和基因工程研究中的热点之一。

表达载体

标志基因

菌株

重组蛋白

pPIC9K

His4, Kan, Amp

GS115

Xylanase

GS115

Porcine circovirus type 2

GS115

Endo‐1,3(4)‐b‐d‐glucanase

GS115

Staphylokinase

pPICZα

Shble

SMD1168

Human chitinase

GS115

Human topoisomerase I

GS115

Human interferon gamma

X‐33

C‐reactive protein

SuperMan5

Insulin

X‐33

Human RNase4

pHIL‐S1

His4, Amp

GS115

Rabies virus glycoprotein

GS115

Rhizopus oryzae Lipase

KM71

Camel lactoferricin

pGAPZα

Shble

GS115

Acyl homoserine lactonase

SMD1168

Variable lymphocyte receptor B

X‐33

Human gastric lipase

pJL‐SX

FLD1, Amp

MS105

Formaldehyde dehydrogenase

pBLHIS‐SX

His4, Amp

JC100

Leukocyte protease inhibitor

常见的用于生产分泌蛋白的毕赤酵母表达载体【1】

 

表达载体

标志基因

菌株

重组蛋白

pPIC3.5K

His4, Kan, Amp

KM71

Maltooligosyltrehalose synthase

SMD1168

Camellia sinensis heat shock protein

GS115

Pleurotus ostreatus laccases

GS115

Rhizopus oryzae Lipase

GS115

HSA/GH fusion protein

pPICZ

Shble

X‐33

Aquaporin

KM71

Membrane protein

KM71

Dengue virus envelope glycoprotein

pHIL‐D2

His4, Amp

GS115

Prostaglandin H synthase‐2

GS115

CatA1 and SODC

KM71

Rhodococcus nitrile hydratase

GS115

Feline serum albumin

pGAPZ

GS115

GTPase RabA4c

GS115

Xylose isomerase

GS115

β‐Galactosidase

pJL‐IX

FLD1, Amp

MS105

Formaldehyde dehydrogenase

pBLHIS‐IX

His4, Amp

KM71

L1‐L2 proteins of HPV virus type 16

常见的用于生产胞内蛋白的毕赤酵母表达载体【1】

 

毕赤酵母基因改造技术

1. 基于线性化质粒载体的同源重组

同源重组技术是一种利用生物体自身修复机制的基因工程技术。在毕赤酵母中,通过将线性化的质粒载体引入,可以高效地将外源基因整合到宿主基因组的特定位点。这一过程依赖于同源臂序列,这些序列与目标基因组区域具有高度相似性,从而促进了质粒载体与宿主DNA之间的重组。这种方法的优势在于其操作简便、整合效率高,可以实现外源基因的多拷贝插入,这对于提高基因表达水平和蛋白质产量至关重要。在工业生产中,这种技术常被用于优化基因表达,以满足生物制药和工业酶生产的需求。此外,同源重组技术还可以用于基因功能研究、疾病模型构建以及生物技术产品的开发。


2. 基于CRISPR/Cas9的基因编辑

CRISPR/Cas9系统是一种革命性的基因编辑技术,它通过利用指导RNA(gRNA)引导核酸酶Cas9精确切割目标DNA序列。这种特异性的切割触发了细胞内的修复机制,包括非同源末端连接(NHEJ)和同源定向修复(HDR),从而实现基因的敲除、插入或替换。CRISPR/Cas9技术以其高效性和精准性在基因组编辑领域占据重要地位,特别适用于复杂代谢途径的优化和多基因编辑。在毕赤酵母中,CRISPR/Cas9技术已被广泛应用于基因功能研究、菌株改良以及生产性能的提升。例如,通过敲除或替换特定基因,可以增强宿主菌的蛋白质表达能力或改变其代谢特性,以适应特定的工业生产需求。


3. 基于CRISPR/Cas12的基因编辑

CRISPR/Cas12系统,也称为Cpf1,是CRISPR家族中的另一种基因编辑工具。Cas12蛋白具有广泛的靶向能力和单链DNA切割特性,使其在基因组编辑中具有独特的优势。与Cas9相比,Cas12对靶位点的PAM(原始间隔短回文重复序列)依赖性更宽松,这为基因编辑提供了更大的灵活性。CRISPR/Cas12系统在表观遗传调控和新型生物技术的开发中展现出巨大潜力,例如,它可以用于研究基因沉默、激活以及DNA甲基化等表观遗传修饰。此外,Cas12的单链切割特性使其在开发新型核酸检测技术、基因治疗策略以及合成生物学应用中具有独特的应用前景。在毕赤酵母中,CRISPR/Cas12技术的应用还相对较新,但已有研究表明,它在基因组编辑和基因功能研究中具有巨大的潜力。

 

毕赤酵母创新突破

经过几十年的广泛应用,毕赤酵母表达系统已成功表达了数以千计的异源蛋白,其中大部分为医药制品。美国FDA 对该系统的认可,如 Cephelon 制剂的获批,充分证明了其安全性和有效性。在我国,虽然目前上市的基因工程药物大多源于大肠杆菌原核表达系统,但毕赤酵母表达系统凭借其国际上的广泛认可,必将在未来的医药市场中占据重要地位。

 

必威生物

酵母基因编辑 & 重组蛋白表达平台

必威生物利用CRISPR等新技术,实现了对毕赤酵母基因组的精准编辑,包括基因敲除、插入和替换。我们成功敲除了GS115菌株的KU70基因,显著提高了毕赤酵母的重组效率和外源基因的整合频率,同时敲除了pep4基因,降低了外源蛋白被降解的风险。

我们深耕合成生物学领域,拥有丰富的基因合成、重组蛋白表达和基因编辑经验。我们提供一站式解决方案,帮助解决毕赤酵母蛋白表达和基因改造的需求,最大限度缩短研发周期

 

》案例展示

通过对毕赤酵母GS115的基因改造,提高了菌株对外源蛋白的表达和分泌。并利用该重组菌株成功表达了多个人源重组蛋白的高效分泌表达,培养液中杂蛋白很少,产量预计可达10g/L。

 



 

》免费样品测试

· 可免费提供少量蛋白样品以供测试。

· 菌株、蛋白等相关信息可联系本司咨询。

 

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未来展望

毕赤酵母表达系统以其高表达、高密度、多样化翻译后修饰以及无内毒素和病毒的安全性等优势,成为重组蛋白表达的优选平台。CRISPR/Cas9等基因组编辑技术的应用将进一步推动该系统的发展,助力重组人源蛋白在生物医药、美容护肤等领域的研究和应用。

重组胶原蛋白基因的选择和设计、表达条件的优化和验证对于获得高产量的蛋白至关重要。必威生物提供从“序列优化”到“基因合成”到“重组胶原蛋白表达”一站式服务。高效的基因合成、多种表达体系协助您在实验室低成本无限合成,提高胶原蛋白的表达量、亲水性和可加工性,创造更多应用可能。

 

参考文献

[1] Karbalaei M, Rezaee S A, Farsiani H. Pichia pastoris: A highly successful expression system for optimal synthesis of heterologous proteins[J]. Journal of cellular physiology, 2020, 235(9): 5867-5881.

[2] De S, Mattanovich D, Ferrer P, Gasser B. Established tools and emerging trends for the production of recombinant proteins and metabolites in Pichia pastoris. Essays Biochem. 2021 Jul 26;65(2):293-307.

[3] Cos, O. et al. (2006). Microbial Cell Factories, 5, 1-20.
[4] Staley, C. A. et al. (2012). Gene, 496(2), 118-127.
[5]覃晓琳et al. (2010).生物技术, 20(3), 4.
[6]周则迅&袁汉英. (2000).复旦学报:自然科学版(3), 264-268.
[7] Siegel, R. S. & Brierley, R. A. (1989). Biotechnology and bioengineering, 34(3), 403-404.
[8] Liu, Q. et al. (2019). Microbial cell factories, 18, 1-11.

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